Bei mir macht conky Probleme wenn es ein paar Minuten gelaufen ist. Die Schriften werden mehrfach auf einer Stelle gezeichnet und man kann nichts mehr richtig lesen.
Nach ewigen rumfrickeln war die einfachste Lösung conky alle 5 Minuten neu zu starten. Das klappt am einfachsten, wenn man eine Kopie der conky Konfiguration auf die aktuelle Konfiguration kopiert. Conky erkennt die "Änderung" und liest neu ein und zeichnet auch das Fenster neu.
crontab
*/5 * * * * user cp .conkyrc_backup .conkyrc